作者:王利民等   来源:   发布时间:2022-07-26   Tag:   点击:
[麻进展]应用AMMI模型分析胡麻品种稳定性

 要:为深入分析胡麻区域试验资料,科学评价参试品种基因与试点环境效应,为胡麻品种登记试验结果分析提供依据,基于2015—2016年甘肃省胡麻区域试验数据资料,应用AMMI模型分析了参试胡麻品种的稳定性、适应性和试点代表性。研究结果表明:两年20点次试验基因G、环境E和交互作用G×E均达显著水平P<0.05,环境E、基因与环境的交互作用G×E对胡麻产量具有重要影响。AMMI模型将基因与环境的交互作用G×E分解为3个互作显著的主成分IPCA1IPCA2IPCA3,分别解释了基因与环境交互作用G×E变异信息的62.10%、21.19%和6.32%。按照稳定性参数值Di大小排序,参试品种Di值大小顺序为G10>G2>G9>G4>G1>G5>G6>G7>G8>G12>G11>G3,12个参试品种中G3、G11和G12的稳定性最好,G10、G2和G9稳定性最差,其余品种稳定性一般;试点Di值大小顺序为E2>E6>E7>E4>E1>E8>E3>E9>E5>E10,10个试点中E2景泰县试点代表性最好,E10镇原县代表性最差。受基因与环境的交互作用大小G×E的影响,不同品种在不同试点具有其特殊适应性。AMMI双标图更直观地展示了品种的稳定性、适应性和试点的代表性。本研究为甘肃胡麻区域试验试点设置和数据统计分析提供了重要依据。

关键词:胡麻区域试验AMMI模型

 

新的《中华人民共和国种子法》已于2016-1-1起正式实施郭利磊和张笑晴2019。新《种子法》规定对除五大主要农作物之外的非主要农作物实行品种登记制度,这是中国品种审定制度的重大改革。农业农村部《第一批非主要农作物登记目录》将亚麻胡麻列为非主要农作物实行品种登记。

胡麻,油用型亚麻Linum usitatissimum L.,是甘肃省的主要油料作物之一,年播种面积约100000hm2,年产胡麻籽约150000t,面积和总产均居全国各省区首位。此前,胡麻一直作为甘肃省的主要农作物实行品种审定,区域试验是胡麻品种审定、登记的重要环节和主要依据。与胡麻育种工作同步,甘肃省就组建了本省的胡麻品种区域试验网络,区域试验在甘肃胡麻品种选育方面发挥了的重要的支撑作用。自上世纪60年代以来,甘肃省相继育成‘陇亚系列’、‘定亚系列’、‘天亚系列’、‘张亚系列’等胡麻新品种50余个,标志性品种如国内首个高抗枯萎病品种‘陇亚7号’,世界首个胡麻杂交种‘陇亚杂1号’,抗旱丰产品种‘定亚23号’,高亚麻酸品种‘张亚2号’等,胡麻品种实现了5~6次品种更新,这些品种的选育和推广应用为甘肃及全国胡麻产业发展做出了重要贡献。随着非主要农作物品种登记制度的实施,区域试验将继续作为甘肃省胡麻品种登记的主要试验支撑。作为甘肃省胡麻区域试验的主持单位,近年来发现一些试点的试验效果并不理想。此外,对于胡麻区域试验数据的分析手段还较为单一,缺乏对基因型G与环境互作G×E的深入分析。

有关作物区域试验资料的统计分析方法众多,前人提出了LRLinear regression模型、PCAPrincipal components analysis模型、AMMIAdditive main effects and multiplicative interaction模型、GGEGenotype plus genotype environment interaction双标图、高稳系数法等多种分析方法,不同模型各有其优缺点张群远和孔繁玲2002常磊等2013张萌等2018。由Gauch等提出的AMMI模型是一种较为理想并广泛应用的作物区域试验模型分析方法,相比其他模型因其具有较高的精确度而被国内外育种家广泛应用于小麦Mohammadi et al.2017Tekdal and Kendal2018姚金保等2021、水稻Sharifi et al.2017Jain et al.2018曹元元等2021、玉米Bernardo Júnior et al.2018魏常敏等2021、棉花朱晓平等2014Riaz et al.2019Teodoro et al.2019、马铃薯李亚杰等2013Muthoni et al.2015等农作物品种区域试验数据结果的统计分析。为深入统计分析和挖掘以往胡麻区域试验数据资料,本研究采用目前广泛应用的AMMI模型对2015—2016年甘肃省胡麻区域试验进行再分析,旨在深入了解胡麻基因与环境的交互作用G×E,以期为今后胡麻品种区域试验的科学分析、试点设置与新品种登记推广提供依据。

 

1结果与分析

1.1方差分析、线性回归分析与AMMI模型分析

从参试品种及试点的平均产量看1,品种间、试点间产量存在明显差异。从品种效应看,G2、G1和G7平均产量较高,分别为1873.32kg/hm21783.89kg/hm21771.37kg/hm2,居参试品种前3位;G10、G4平均产量较低,分别为1380.97kg/hm21463.88kg/hm2,居参试材料后两位;其余材料介于1644.91kg/hm2~1735.396kg/hm2之间。从试点效应看,E6和E8试点平均产量最高,分别达2242.29kg/hm22138.77kg/hm2E10和E5试点产量水平较低,分别仅为1124.37kg/hm21263.57kg/hm2;其余试点介于1476.17kg/hm2~1852.33kg/hm2

1参试品种试点及平均产量

参试品种

Tested varieties

代码

Code

平均产量kg/hm2

Average yieldkg/hm2

试点

Testing sites

代码

Code

平均产量kg/hm2

Average yieldkg/hm2

99012-13

G1

1783.89

永登县

Yongdeng County

E1

1786.59

99009-1-11

G2

1873.32

景泰县

Jingtai County

E2

1751.36

113×9622

G3

1710.05

榆中县

Yuzhong County

E3

1852.33

1S×2000-16

G4

1463.88

清水县

Qingshui County

E4

1502.26

07823

G5

1752.26

安定区

Anding District

E5

1263.57

2000-5125

G6

1768.90

甘州区

Ganzhou District

E6

2242.29

2003-22-4-2-1-1

G7

1771.37

白银区

Baiyin District

E7

1711.33

0523-16-1

G8

1720.77

静宁县

Jingning County

E8

2138.77

0523-48-1

G9

1613.05

崆峒区

Kongtong District

E9

1476.17

9825-1

G10

1380.97

镇原县

Zhenyuan County

E10

1124.37

9813-1-2-1

G11

1644.91

 

 

 

陇亚10号CK

Longya10CK

G12

1735.39

 

 

 

在各试点产量方差同质性检验的基础上,对参试品种产量进行方差分析,结果表明2:基因G、环境E和交互作用G×E均对品种产量存在重要影响。他们的平方和SS分别占总平方和的10.45%、65.29%和24.26%,均达显著水平P<0.05,其中,环境E平方和占总平方和的比例达65.29%,对产量的影响最大;基因与环境的交互作用G×E次之,其平方和占总平方和的24.26%,是基因G平方和的2.3倍;而基因G的作用只占10.45%,远小于前二者的作用。这表明环境E、基因与环境的互作G×E是影响胡麻产量的主要部分。此外,通过线性回归分析结果表明2,联合回归和基因回归的平方和SS分别仅占总平方和1.93%和2.91%P>0.05,环境回归的平方和SS虽然占总平方的45.73%且达极显著水平P﹤0.01,但残差仍然很大49.42%,说明线性回归模型对基因与环境互作G×E的解释并不充分,对本试验数据的拟合效果不理想。

在方差分析和线性回归分析中,均未能对基因与环境的交互作用G×E做出充分的解释。为进一步挖掘基因与环境的交互作用G×E,采用AMMI模型对交互作用G×E进行分解,结果表明2:前3个互作主成分IPCA均达到了显著水平P<0.05IPCA1、IPCA2、IPCA3分别解释了基因与环境交互作用G×E62.10%、21.19%和6.32%,这三者累计解释了G×E的89.60%,而残差除前3个互作显著的主成分外不显著的IPCA仅为10.4%。可见,与线性回归模型仅解释了50.58%的互作相比,AMMI模型更能有效的对基因与环境的互作G×E做出有效的解释。

2胡麻产量方差分析线性回归分析和AMMI模型分析

变异来源

Source of variation

自由度

Degrees of freedom

平方和

Sum of squares

平方和百分比%

Percentage of sum of squares%

均方

Mean square

F值

F value

P值

P value

方差分析

Analysis of variance

总的

Total variance

119

36.923

100.00

0.3103

 

 

基因

GenotypeG

11

3.8584

10.45

0.3508

6.3382

0.0001

环境

EnvironmentE

9

24.1063

65.29

2.6785

48.3985

0.0001

交互作用

Genotype×EnvironmentG×E

99

8.9582

24.26

0.0905

1.635

0.0117

线性回归分析

Analysis of linear regression

联合回归

Joint-regression

1

0.1733

1.93

0.1733

3.1322

0.0806

基因回归

Genotype-regression

10

0.2607

2.91

0.0261

0.4712

0.9039

环境回归

Enviornment-regression

8

4.0968

45.73

0.5121

9.2533

0.0001

残差

Residual

80

4.4274

49.42

0.0553

 

 

AMMI模型分析

Analysis of AMMI model

PCA1

19

5.563

62.10

0.2928

15.0896

0.0001

PCA2

17

1.898

21.19

0.1116

5.7539

0.0001

PCA3

15

0.5659

6.32

0.0377

1.9443

0.0416

残差

Residual

48

0.9314

10.40

0.0194

 

 

1.2基于稳定性参数Di的品种稳定性与试点鉴别力分析

AMMI模型分析的基础上,利用稳定性参数Di进一步分析参试品种的稳定性与试点代表性。稳定性参数Di是反映品种稳定性与试点代表性的定量指标,Di值越小,品种的稳定性就越好;Di值越大,试点的代表性和鉴别力就越强。基于前3个互作显著的主成分得分值计算参试品种和试点的Di值并进行排序3,参试品种的Di值大小顺序为:G10>G2>G9>G4>G1>G5>G6>G7>G8>G12>G11>G3。参试品种G3、G11和G12的稳定性最好,G10、G2和G9稳定性最差,其余品种稳定性一般。另外,结合产量结果来看,稳产性好的品种,产量表现则较一般,如G3、G11、G12;产量表现好的品种,稳定性并不好,如品种G2,其产量表现突出,但稳定性很差。各试点的Di值进大小顺序为:E2>E6>E7>E4>E1>E8>E3>E9>E5>E10。试点E2景泰县的品种鉴别力最强,试点E6甘州区E7白银区对品种的鉴别力次之;试点E9崆峒区E5安定区E10镇原县对品种的鉴别力较差,其中试点E10镇原县代表性最差。

3品种试点的稳定性参数

代码

Code

平均产量kg/hm2

Average yieldkg/hm2

主成分得分

Principle component score

稳定性参数Di

Stability parametersDi

排序

Order

PCA1

PCA2

PCA3

品种

varieties

G1

1783.89

0.4798

0.2033

-0.1514

0.3914

5

G2

1873.32

0.7404

0.2000

-0.2460

0.5939

2

G3

1710.05

0.0001

0.2759

0.3582

0.1557

12

G4

1463.88

-0.4915

-0.2464

0.1186

0.4047

4

G5

1752.26

-0.1943

-0.6407

-0.1174

0.3336

6

G6

1768.90

0.1838

-0.6164

-0.0012

0.3186

7

G7

1771.37

0.3114

0.2363

0.0681

0.2690

8

G8

1720.77

0.2137

-0.2576

0.3840

0.2275

9

G9

1613.05

-0.6633

0.2904

-0.0081

0.5395

3

G10

1380.97

-0.8090

0.2748

-0.2822

0.6538

1

G11

1644.91

0.1583

-0.0145

-0.4309

0.1654

11

G12

1735.39

0.0705

0.2949

0.3084

0.1659

10

试点

testing sites

E1

1786.59

0.1572

-0.5403

0.0465

0.2781

5

E2

1751.36

1.3538

0.1856

-0.1784

1.0712

1

E3

1852.33

-0.1044

-0.4309

0.1409

0.2176

7

E4

1502.26

-0.1718

-0.5512

-0.2873

0.2965

4

E5

1263.57

-0.1123

0.0897

0.4336

0.1464

9

E6

2242.29

-0.5476

0.0936

-0.4582

0.4487

2

E7

1711.33

-0.2184

0.6421

-0.2304

0.3469

3

E8

2138.77

-0.2031

0.3169

0.3555

0.2343

6

E9

1476.17

-0.2310

0.1788

-0.0177

0.1998

8

E10

1124.37

0.0776

0.0157

0.1955

0.0788

10

1.3AMMI双标图分析

1.3.1AMMI1双标图

双标图Biplot是解释AMMI模型分析结果的一个非常有效而直观的工具。分别以品种和试点的平均产量为x坐标轴、IPCA1值为y坐标轴绘制散点图,就构成AMMI1双标图1,该双标图同时反映了基因G、环境E和交互作用G×EAMMI1双标图水平方向x轴主要反映了品种G和试点E的变异。可以看出,试点间的变异要显著大于品种间的变异,试点平均产量主要分布于1100kg/hm2~2300kg/hm2;而品种间的变异相对较小,品种平均产量主要分布于1300kg/hm2~1900kg/hm2。垂直方向y轴主要反映了基因与环境的交互作用的方向和大小G×E。品种与试点图标位于x轴的同侧为正向交互作用,异侧为负向交互作用。如品种G1、G2、G3、G6、G7、G8、G11、G12与试点E1、E2和E10具有正向交互作用,与其余试点具有负向交互作用。品种的IPCA1绝对值越小,其与试点的交互作用就越小,亦即品种图标越接近x轴,则品种的稳定性就越好。品种G3、G11、G12的图标较接近x轴,表明这些品种和环境的交互作用较小,其稳定性较好;品种G1、G2、G4、G9、G10的图标较远离试点x轴,表明这些品种和环境的交互作用较大,其稳定性较差。同时,试点的IPCA1绝对值越大,即试点的图标越远离x轴,则试点的鉴别力越强。图中试点E2、E6的图标明显远离于x轴,表明其试点鉴别力较强,这与前面的Di值排序分析结果基本一致。

  

1品种稳定性和试点代表性

1.3.2AMMI2双标图

如前所述,高产的品种不稳定,稳定的品种不高产,其原因可能主要受基因与环境交互作用G×E的影响,不同品种在不同生态区具有其特殊适应性。由于主成分IPCA1和IPCA2总共解释了基因与环境交互作用83.29%的变异信息,分别以品种和试点IPCA1值为x坐标轴、IPCA2值为y坐标轴绘制散点图,并将试点图标与原点连线,即构成AMMI2双标图2,该双标图可直观地反映品种的特殊适应性。AMMI2双标图中,品种的特殊适应性取决于品种在试点与坐标原点连线的垂直投影与坐标原点的距离长短,即品种与试点交互作用的大小,交互作用越大,品种特殊适应性越强王磊等1997。品种G1、G2和G7在试点E2,品种G4、G5、G6和G8在试点E1、E3和E4,品种G9、G10在试点E6、E7、E8和E9具有的特殊适应性,最适宜在这些试点区域推广应用;而品种G4、G5、G9和G10在试点E2,品种G4、G5、G6、G8在试点E7并不适应,这些品种受与试点负向交互作用的影响而不适宜在这些生态区推广种植。

  

2品种适应性

2讨论

胡麻是甘肃省的优势和特色油料作物之一,因其具有耐旱、耐寒、耐瘠薄、适应性广等特征特性,与甘肃省的生态气候条件相一致,在满足产区人民食用植物油有效供给和助力农民增产增收方面发挥着重要作用。丰产、稳产、抗逆是胡麻新品种选育的主要方向之一。近年来,受前期干旱少雨、低温冻害,后期降雨倒伏等极端气候的影响,胡麻减产和产量波动较大,丰产、稳产和综合抗逆品种选育日益紧迫。

区域试验是综合评价胡麻丰产性、稳产性和抗逆性的重要途径,也是目前胡麻品种登记的主要依据。从胡麻多年多点区试试验数据看,参试品种在不同试点的表现存在较大的差异,丰产性和稳产性较难兼具,表明基因型与环境交互作用G×E是显著存在,采用适宜的统计方法对区域试验数据进行科学而全面的分析显得十分重要。前人研究结果表明,不同数据分析模型都有其优缺点,目前广泛应用的AMMI模型和GGE双标图评价结果具有一致性,两者的分析结果都更为全面和直观常磊等2013。本研究方差分析结果表明,在影响胡麻产量的3因素中,基因G、环境E及其交互作用G×E的权重分别占10.45%、65.29%和24.26%,可见环境E、基因与环境的交互作用G×E对胡麻产量具有重要影响,且G×E的作用远大于G的作用,这与小麦姚金保等2021、水稻Sharifi et al.2017、糜子李辛村等2012等作物的研究结果相一致。应用AMMI模型对甘肃省胡麻区域试验基因与环境的交互作用G×E进行了有效分解,前3个显著互作主成分IPCA1、IPCA2、IPCA3分别解释了G×E互作的56.32%、25.66%、7.51%,累计解析度达89.49%。与方差分析和线性回归模型分析相比,AMMI模型更能对G×E信息做出有效的解析。

利用稳定性参数Di结合AMMI双标图分析,可以对品种稳定性、适应性及试点鉴别力做出准确而直观的评价。从品种效应看,12个参试品种稳定性存在显著差异,按Di值大小排序为:G10>G2>G9>G4>G1>G5>G6>G7>G8>G12>G11>G3,稳定性最好的品种为G3,最差的品种为G10。从地点效应看,10个试点鉴别力也存在显著差异,按Di值大小排序为:E2>E6>E7>E4>E1>E8>E3>E9>E5>E10,E2的试点鉴别力最好,E10的试点鉴别力最差。这些品种与试点的差异信息,借助AMMI1双标图可以直观地呈现出来。同时,品种稳定性之所以不同,是因为显著的基因与环境交互作用G×E的存在,AMMI2双标图很好地反映了品种的特殊适应性。因此,AMMI模型较以往简单的方差分析更能全面、准确的反映胡麻区域试验参试品种和试点的信息。针对甘肃省胡麻区域试验数据统计分析中存在的问题,特别是试点设置的代表性,目前已经做出了一定的调整,取消了一些代表性较差的试点。在今后的试验中建议将AMMI模型分作为胡麻区试分析的重要内容,以更全面、准确和直观的评价供试材料的优劣以及试点设置的科学性。

 

3材料与方法

3.1参试材料及试点

2015~2016年甘肃省胡麻区域试验参试品种共12份含对照品种,其中:甘肃省农业科学院参试材料4份G1G2G3G4;甘肃农业职业技术学院参试材料3份G5G6G7,定西市农业科学研究院参试材料2份G8G9,张掖市农业科学研究院参试材料2份G10G11,以‘陇亚10号’G12为对照品种。甘肃全省设置试点10个,分布于甘肃东部、中部和西部10个县区1

3.2试验方法

试验地选择地势平坦、地力中等的地块,前茬为小麦、玉米油菜等作物皆可。按照随机区组试验设计,小区面积13.4m26.7m2.0m3次重复。每小区种植10行,行距20cm,播种密度为900万粒/hm2,采用人工撒播,播深3~4cm,四周设保护行。施肥、灌水、中根除草等田间管理与当地生产方式基本一致,田间记载生育期,成熟后取样调查主要农艺性状,按小区全区收获计产。

3.3数据统计分析

试验数据统计和双标图绘制采用MicrosoftExcel2010软件,AMMI模型分析采用DPS7.05软件。参照吴为人吴为人2000改进和提出的AMMI模型稳定性分析方法计算参试品种和试点的稳定性参数Di,计算公式如下:

Di=∑i=1nωnγin2−−−−−−−−−√Di=∑i=1nωnγin2

式中,n是显著的IPCA个数,ωn为权重系数,表示第n个显著IPCA的平方和SS占总的平方和的比值,γin表示第i个品种基因或试点环境在第n个显著的IPCA上的得分值刘丽华等2013

 

参考文献

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文章摘自:王利民,张建平,党照,赵玮,李闻娟,谢亚萍,齐燕妮,汪平。应用AMMI模型分析胡麻品种稳定性、适应性与试点代表性[J/OL].分子植物育种:1-10[2022-07-11].


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