作者:王昕慧等   来源:   发布时间:2021-11-08   Tag:   点击:
[麻进展]苎麻种质资源遗传多样性分析研究进展

  要:作物种质资源是选育作物新品种的基础。作物种质资源多样性包括物种多样性和遗传多样性,而遗传多样性是生物多样性的核心。作物的种质资源遗传多样性研究包括作物的表型、细胞学、生化以及分子水平四个方面。苎麻是我国四大纤维作物之一,种植面积占全世界种植面积的90%以上,我国具有丰富的苎麻种质资源。从以上4个方面对苎麻种质资源进行综述,并根据苎麻种质资源研究的现状,提出苎麻在种质资源研究中的主要问题,以期为苎麻种质资源的研究、利用及新品种选育提供参考。

关键词:苎麻;种质资源;遗传多样性;分子标记;

 

全世界荨麻科(Urticaceae)植物有47属,约1300种,分布于热带与温带,其中苎麻属(Boehmeria)约有120种,30种左右分布于美洲,75种分布于亚洲,少量分布于非洲和大洋洲,我国已发现有3211变种[123]。苎麻是我国四大纤维作物之一,被称作中国草南京草[4]。我国苎麻种植面积和产量占全世界的90%以上,在国际市场上占主导地位[5]

种质资源遗传多样性是生物多样性的核心,是育种和资源保护的基础。在杂交中,遗传多样性非常重要;对植物进行遗传多样性评估是鉴定、保存遗传资源和设计育种方案的第一步[6]。研究苎麻种质资源的遗传多样性,有助于分析苎麻种质资源间的遗传关系,对于拓展苎麻种质资源的遗传基础,探索优质基因,开发新品种,促进苎麻种质资源的可持续利用具有重要意义。本文从细胞学、形态学、生物化学和分子水平对苎麻种质资源的遗传多样性进行综述。

1表型性状

表型性状是植物的外在表现,是通过形态标记进行研究。形态标记是指肉眼可见的或仪器测量的植物在生长发育过程中的外部特征。形态标记可对质量性状和数量性状进行标记。因此,形态标记在育种中有重要作用[789]。不同种质的表型存在差异,它是苎麻品种分类的依据。苎麻是我国传统经济作物,栽培历史悠久,长期的自然选择和人工选择以及频繁种质交流,产生了丰富的表型性状。我国苎麻属植物分为5个组31种,21个变种[10]。目前,我国建成了世界上保存种类最丰富的国家苎麻种质资源圃,收集了近3 000份苎麻种质。苎麻种质的表型性状主要包括苎麻的蔸型、株型、叶型、叶色、叶毡毛、根型等。

苎麻种质资源较丰富,不同的苎麻资源表型性状差异较大。林敏荣等[11]通过对27个苎麻地方品种的叶形、叶色、叶缘锯齿、叶柄着生角度、叶面皱纹、茎毛、茎形、茎型、根型、根系类型、雌蕾色和蔸型等12个形态特征的调查,采用DPS进行聚类分析,在遗传距离5.21处将27个品种分为4类,在遗传距离为3.65时,则为10个类群,对选育优良苎麻品种具有重要的指导意义。白玉超等[12]通过株高、茎粗、鲜皮厚度、分株数、有效株率、地上部生物量6个农艺性状对94份苎麻种质资源进行关联分析,得出鲜皮厚对地上生物量的影响最大,株高和茎粗次之,并筛选出一些优良的种质。李林林等[13]通过对94份苎麻种质的株高、茎粗、皮厚、有效株率、有效株、单蔸分株数和单蔸生物量等7个农艺性状进行聚类分析,得到3个聚类群,为苎麻优质高产育种的亲本选配提供参考价值。在作物育种中形态标记虽简单易懂,但受环境的影响,种群间的遗传变异无法准确掌握。

2细胞学标记

细胞学标记主要指染色体核型和带型,是作物细胞遗传标记之一[14]。染色体是遗传物质的载体,染色体数量、结构变化会导致遗传物质变化。目前,许多苎麻研究者将细胞学标记应用于苎麻研究中。臧巩固[15]研究苎麻属3个分类学组中5个种核型,其中24种为首次报道;序叶苎麻(B.clidemioides)的核型为:2n=28=6t+22T+1B,苎麻的核型为:2n=28=4st+2t+20T+2st(SAT),大叶苎麻(B.longispica)的核型为:2n=42=6t+36T,悬铃木叶苎麻(B.platanifolia)的核型为:2n=42=8t+32T+2st(SAT),长叶苎麻(B.macrophylla)的核型为:2n=42=1m+8t+33T。通过核型比较,讨论苎麻属植物的染色体基数及进化趋势,首次提出苎麻属的染色体基数可能是7,异源多倍化是苎麻属植物的主要进化途径之一。张波等[16]对几种野生苎麻染色体研究,发现染色体倍性较高,并根据多倍化和核型分析,提出苎麻染色体的演化趋势:2n=28→2n=4256。杨瑞芳等[17]7份野生苎麻材料进行Giemsa C-带带型及染色体核型分析,结果显示7份材料均为近端着丝点型,核型公式分别为2n=28=28st 2n=42=42st2n=56=56st

虽然细胞学标记不受环境因素的影响,但仍存在很多问题,对染色体切片的制作技术要求较高,标记数量较少;且同一物种个体间染色体的数目不同。因此,研究苎麻种质资源遗传多样性,不能仅靠细胞学标记来定位。

3生化标记

生化标记的特征是以基因表达产物(蛋白质)的遗传标记,包括两种标记手段,一是同工酶标记,另一种是贮藏蛋白标记,结构多样性可反应作物DNA组成和作物遗传多样性。酶谱相似度可预测种间亲缘关系,相似度越高,亲缘关系则越近[18]。胡能书等[19]233个苎麻品种进行酯酶同工酶标记分析其亲缘关系,初步构建苎麻演化树。胡能书等[20]213个苎麻栽培品种进行过氧化物酶同工酶分析,将其归纳为41种生态型。蒙祖庆[21]运用同工酶技术对38份苎麻种质(其中8份为栽培种)进行分析,共检测到146条酯酶同工酶谱带,统计表明:野生种产生酶带数15条不等,栽培种产生酶带数79条不等,共21个类型,通过聚类分析得到5个聚类群。

同工酶标记应用于苎麻种质资源的分类研究中,存在着同工酶的含量和酶活性在作物不同生长阶段存在差异[22],且同工酶基因的表达受不良环境的影响等[232425]。因此,需结合其他标记技术来开展研究。

4分子标记

分子标记是基于个体间遗传物质核苷酸序列差异的标记,直接反应 DNA 水平单核苷酸多态性。遗传多样性评估对有效组配育种材料和改良作物性状至关重要[262728]。分子标记具有快速、准确、多态性好等特点,通过分子标记的多态性分析可准确评价苎麻遗传多样性。目前,主要有RAPDSSRISSRSRAP等分子标记用于苎麻遗传多样性的研究。

4.1 RAPD标记

RAPD(随机扩增多态性DNA标记)技术是建立在PCR基础上对基因进行多态性分析的分子技术。该技术在苎麻遗传多样性研究中发挥重要作用。

揭雨成等[29]利用RAPD技术对抗旱性较弱和较强的基因型材料各6个品种进行亲缘关系分析,将其聚成两类三组,直观地反应材料间的亲缘关系,为苎麻抗旱育种亲本选择及亲缘关系研究提供理论依据。邱财生等[30]利用RAPD分析13份苎麻材料,确立了它们之间的亲缘关系。陈荷泉[31]RAPD分子标记分析44份苎栽培品种的遗传变异,用23RAPD引物扩增出112个条带,多态性带103条,多态性比率91.7%。研究表明,RAPD技术在亲缘关系分析和遗传多样性检测上具有较大的潜力。

4.2 SSR标记

SSR标记技术通过分析遗传物质的多态性来鉴别植物核苷酸排布及规律。陈建华[32]采用SSR分子标记分析了158份苎麻核心种质的遗传多样性,发现核心种质资源遗传变异广泛,根据引物检测到的种质遗传多样性图谱可以将158份种质分成10类。Kim[33]开发了苎麻的SSR标记,选择了17SSR标记,分析了90份苎麻种质资源的遗传多样性,共检测到140个等位基因,每个序列317个等位基因,平均遗传多样性值为0.61,范围为0.370.84,平均多态信息含量为0.56,范围为0.340.82,基于SSR数据的遗传聚类分为4类。Ni[34]利用23SSR标记和3个表型标记分析了13个地区(中国、巴西、印度、古巴等)1151个苎麻种质资源的遗传多样性和种群结构,结果确定了117个位点,Shannon多样性指数范围为0.32011.6773(平均值0.8272),多态信息含量为0.15780.7603(平均值0.5017),预期杂合度为0.16940.7815(平均值0.5282),遗传多样性为0.17220.7884(平均值0.5228);四川、云南和贵州的遗传多样性高于其他地区。基于非加权对组方法的算法均值和遗传距离的聚类分析揭示了国内外种质资源存在明显差异。种群结构分析也证明野生种质遗传多样性高于驯化种质。Luan[35]使用95SSR引物和107份苎麻种质,研究了与苎麻纤维产量性状相关的SSR位点,并进行关联分析,结果表明107份种质可分为两亚群,关联分析检测到16个与苎麻产量性状相关的稳定分子标记。钟新月[36]筛选出39SSR引物,逐一对19个耐低磷差异基因型苎麻DAN进行扩增,结果均有多态性,对引物的扩增条带进行聚类分析,可以将19份材料聚为四类。许岳军等[37]利用SSR标记技术对8份苎麻种质进行遗传分析,结果表明8份苎麻材料的遗传相似系数为0.6690.859,在相似系数0.72处可将其分为3类。上述研究表明,SSR标记技术对苎麻基因间的遗传关系能进行有效分析。

4.3 ISSR标记

ISSR标记是简单可靠的DNA分子标记技术[3839]。丁明忠等[40]21ISSR引物对8份四川苎麻品种的DNA进行扩增,共扩增出86条带,多态性位点71个,聚类分析结果显示,供试品种与母本的遗传距离较远,表现特有的偏父本遗传现象。康冬丽[41]利用ISSR标记技术研究了56个苎麻品种的遗传差异,用15ISSR引物共扩增出258条带,有247条多态性带,多态性比率为95.8%,表明苎麻种间遗传差异较大。聚类分析结果显示,在遗传距离0.635处可将其分为5类:来自四川的品种聚成一类,贵州的品种和江西的品种各聚成一类,湖北和湖南的51个品种聚成一类,表明品种()间的亲缘关系与地理位置密切相关。刘立军等[42]利用ISSR标记技术对苎麻自交无性繁殖系遗传关系进行分析,结果表明ISSR标记技术可准确地分析苎麻自交无性繁殖系的亲缘关系和遗传多样性。蒙祖庆等[43]研究发现,ISSR标记技术比RAPD标记技术更适合野生苎麻种质亲缘关系的分析。

4.4 SRAP标记

SRAP是基于PCR技术的标记方法,目前在苎麻遗传多样性研究、检测亲缘关系和遗传图谱的构建等方面得到广泛应用[4445464748]

Liu[49]首次在苎麻自交系中应用SRAP标记,研究33个自交系和2个野生种间的遗传关系。用33个引物获得332个多态性条带,UPCMA聚类分析显示,来自中国和巴西的近交系成一类,表明巴西品种可能是从中国引进发展而来。在苎麻自交系分组中发现品种间的遗传关系与品种起源区域显著相关。Luan[50]利用SRAPSSR标记研究108个苎麻品种的遗传多样性和亲缘关系,显示108个苎麻种质的遗传相似系数在0.220.89之间。利用PCA(主成分分析)UPGMA(未加权的成对组方法和算术手段)108个种质分为两类;Shanon多样性指数为1.1Nei’s的基因多样性指数为0.58。同时还比较了不同省份(四川、江西、湖北、湖南)的遗传多样性,贵州省遗传多样性最高,可能是苎麻的起源中心。

5展望

遗传多样性是作物种质资源保存、开发利用的基础。近年来苎麻在种质资源遗传多样性研究上取得了一定进展,从表型到分子,许多研究表明苎麻具有较高的遗传变异水平,但仍需改进和提升。随着农业发展,育种家保存的种质资源主要是具有优良性状和综合性状好的苎麻材料,导致种质资源遗传基础逐渐变窄,研究工作有局限性。此外,不同研究方法的研究结果也不一致。

今后的苎麻遗传多样性研究应加强品种收集鉴定与保存,避免种质流失;深入了解苎麻种质资源的现状,提高苎麻种质资源的遗传多样性,加强野生苎麻种质的研究和利用,拓宽遗传基础;结合常规手段与分子技术,开展系统深入研究,揭示苎麻表型性状的遗传变异与分子水平上的遗传多态性之间的关系,对遗传育种潜力进行客观评价;对重要的性状进行基因定位,发现优良基因,为苎麻的保护和合理利用提供材料。

 

参考文献

[1]傅立国,陈潭清,郎楷永.中国高等植物,第四卷[J].青岛:青岛出版社,2000:101.

[2]朱睿,杨飞,周波,等.中国苎麻的起源、分布与栽培利用史[J].中国农学通报,201430(12):258266.

[3]LIU F HLIANG X NZHANG N Get al.Effect of growth regulators on yield and fiber quality in ramie(Boemheria nivea(L.)Gaud.)China grass[J].Field Crops Research200169(1):4146.

[4]吕江南,贺德意,王朝云,等.全国麻类生产调查报告[J].中国麻业,200426(2):95102.

[5]程醉.苎麻行业:结构调整和产业升级可是发展契机[J].中国纤检,2018(10):113116.

[6]刘纪麟.玉米育种学[M].北京:中国农业出版社,1999.

[7]宋吉轩,李云,邓仁菊,等.贵州紫心甘薯种质资源形态标记聚类分析[J].北方园艺,2017(18):5861.

[8]陈莹,张法铭,姜辉,等.我国棉花形态标记性状应用研究进展[J].江苏农业科学,201947(18):4650.

[9]NIRUBANA VVANNIARAJAN CBANUMATHY Set al.Morphological and microsatellite markers assessment of rice genetic diversity for phosphorus starvation tolerance breeding[J].Cereal Research Communications202048(3):255265.

[10]王文采,陈家瑞.中国植物志,第二十三卷第二分册[M].北京:科学出版社,1995.

[11]林敏荣,潘其辉,龚秋林,等.苎麻地方品种资源多样性研究[J].中国麻业科学,201638(6):268275.

[12]白玉超,黄敏升,李林林,等.94份苎麻种质资源主要农艺性状关联分析与综合评价[J].中国麻业科学,201739(4):161171.

[13]李林林,黄敏升,崔国贤,等.苎麻种质资源农艺性状主成分及聚类分析[J].中国农业科技导报,201921(3):3441.

[14]张传军,刘亦肖,肖娅萍.遗传多样性与植物的遗传标记[J].陕西师范大学学报(自然科学版)200634(S1):275278.

[15]臧巩固.苎麻属三组五种核型研究[J].中国麻作,1993(1):16.

[16]张波,郑长青,臧巩固,等.中国苎麻属野生近缘种的主要性状和纤维细胞结构的比较研究[J].中国麻作,199618(3):156.

[17]杨瑞芳,郭清泉,程尧楚,等.七份苎麻野生资源的核型及Giemsa C-带带型研究[J].中国麻作,200022(2):611.

[18]VAUGHAN J GDENFORD K E.An acrylamide gel electrophoretic study of the seed proteins of brassica and sinapis specieswith special reference to their taxonomic value[J].Journal of Experimental Botany196819(4):724732.

[19]胡能书,朱泽瑞,郭清泉,等.苎麻酯酶同工酶亲缘关系的初步研究[J].湖南师范大学自然科学学报,199013(1):6570.

[20]胡能书,朱泽瑞,郭清泉,等.苎麻过氧化物酶同工酶演化的初步研究[J].湖南师范大学自然科学学报,199114(1):7377.

[21]蒙祖庆.苎麻野生种质资源遗传多样性及其亲缘关系分析[D].武汉:华中农业大学,2007.

[22]王洪涛.几种同工酶在植物果实发育及衰变过程中变化特点和特性的研究[D].南京:南京农业大学,2007.

[23]TANG S XKNAPP S J.Microsatellites uncover extraordinary diversity in native American land races and wild populations of cultivated sunflower[J].Theoretical and Applied Genetics2003106(6):9901003.

[24]任安芝,高玉葆,陈悦.干旱胁迫下内生真菌感染对黑麦草叶内几种同工酶的影响[J].生态学报,200424(7):13231329.

[25]胡能兵,隋益虎,舒英杰,等.高温胁迫对不同热敏型辣椒同工酶及DNA甲基化的影响[J].西北植物学报,201636(1):131138.

[26]AGARWAL MSHRIVASTAVA NPADH H. Advances in molecular marker techniques and their applications in plant sciences[J].Plant Cell Reports200827(4):617631.

[27]郑永胜,王丽媛,段丽丽,等.350份小麦种质的SSR遗传多样性分析[J].山东农业科学,202052(12):16.

[28]杨婉君,潘香逾,王秀华,等.119个苜蓿品种()产量和农艺性状的遗传多样性分析[J].作物杂志,2020(6):1722.

[29]揭雨成,周青文,陈佩度.麻不同基因型亲缘关系的RAPD分析[J].中国麻作,199921(1):16

[30]邱财生,程超华,赵立宁,等.RAPD标记研究苎麻属植物的亲缘关系[J].湖北农业科学,201150(7):14991501.

[31]陈荷泉.苎麻不同基因型亲缘关系的RAPD分析[D].武汉:华中农业大学,2006.

[32]陈建华.苎麻资源核心种质构建方法及遗传多样性研究[D].北京:中国农业科学院,2012.

[33]KIM H BUHM Y KKIM J Jet al.Development of novel simple sequence repeat markers from ramie(Boehmeria nivea L. Gaudich)and analysis of genetic diversity in its genetic resources[J].HorticultureEnvironmentand Biotechnology201657(5):519528.

[34]NI J LZHU A GWANG X Fet al.Genetic diversity and population structure of ramie(Boehmeria nivea L.)[J].Industrial Crops and Products2018115:340347.

[35]LUAN M BLIU C CWANG X Fet al.SSR markers associated with fiber yield traits in ramie(Boehmeria nivea L. Gaudich)[J].Industrial Crops and Products2017107:439445.

[36]钟新月.耐低磷苎麻筛选及多年生植物成熟叶片蛋白提取方法改良[D].武汉:华中农业大学,2016.

[37]许岳军,马玉申,董静宇,等.基于苎麻转录组测序的SSR序列分析及ESTSSR标记开发[J].分子植物育种,202018(13):43684376.

[38]ZIETKIEWICZ ERAFALSKI ALABUDA D.Genome fingerprinting by simple sequence repeat(SSR)anchored polymerase chain reaction amplification[J].Genomics199420(2):176183.

[39]王笠,赵志礼,倪梁红,等.基于ISSR标记的麻花艽遗传多样性分析[J].中草药,201748(15):31683174.

[40]丁明忠,潘光堂,张中华,等.ISSR分析四川苎麻品种()间的遗传关系及雄性不育分子标记的建立[J].核农学报,200822(2):183187.[41]康冬丽.中国苎麻属植物遗传多样性及其系统发育关系研究[D].长沙:湖南农业大学,2008.[42]刘立军,王绪霞,汪波,等.苎麻自交无性繁殖系遗传关系的ISSR分析[J].中国农业科学,201144(8):15431552.

[43]蒙祖庆,刘立军,彭定祥.利用RAPDISSR标记分析苎麻野生种质资源的遗传多样性[J].分子植物育种,20097(2):365370.[44]谭龙涛,喻春明,陈平,等.苎麻自交纯合进度研究[J].中国农业科学,201447(22):43714379.

[45]栾明宝,邹自征,陈建华,等.苎麻RSAPSSRSRAP分子标记遗传连锁图谱的初步构建[C]//中国作物学会2013年学术年会论文集.郑州,2013:57.

[46]邹自征.苎麻分子标记方法比较和遗传图谱的初步构建[D].北京:中国农业科学院,2012.

[47]邹自征,陈建华,栾明宝,等.应用RSAPSRAPSSR分析苎麻种质亲缘关系[J].作物学报,201238(5):840847.

[48]廖亮,李同建,赵中伟,等.基于SRAP分析苎麻及近缘种的系统学关系[J].广西植物,201030(6):791795.

[49]LIU L JPENG D XWANG B. Genetic relation analysis on ramie[Boehmeria nivea(L.)Gaud.]inbred lines by SRAP markers[J].Agricultural Sciences in China20087(8):944949.

[50]LUAN M BZOU Z ZZHU J Jet al.Genetic diversity assessment using simple sequence repeats(SSR)and sequencerelated amplified polymorphism(SRAP)markers in ramie[J].BiotechnologyBiotechnological Equipment201529(4):624630.


更多阅读